Die namensgebende Vikos-Schlucht ist das Herz des Nationalparks. Sie ist die, offiziell im Guinness-Buch der Rekorde vermerkt, tiefste Schlucht der Welt (zwar ist der amerikanische Grand Canyon noch tiefer, allerdings wesentlich breiter). Auf einer Länge von zehn Kilometern erstreckt sich die Schlucht zwischen den beiden Dörfern Monodendri und Vikos. Am manchen Stellen ragen die Kalksteinwände rechts und links des Flusses rund 1000 Meter in die Höhe, an anderen säumen Blumenwiesen das Ufer. Wer die Schlucht komplett durchwandern möchte, sollte einen ganzen Tag für die Tour einplanen.